MTs N 6 Kulon Progo merupakan salah satu Madrasah yang terletak di wilayah bagian selatan Kabupaten Kulon Progo. Tepatnya di Klampok, Brosot, Galur, Kulon Progo. MTs N 6 Kulon Progo memiliki posisi yang strategis karena berada pada jalur utama lalu lintas Yogyakarta – bandara Yogyakarta International Airport (YIA) jalur selatan. MTs N 6 Kulon Progo berada pada pintu gerbang menuju kabupaten Kulon Progo dari arah Yogyakarta di jalur selatan. Dari pusat kepanewon berjarak 200 m, dan dari pusat kabupaten berjarak kurang lebih 18 km.
MTs Negeri 6 Kulon Progo mempunyai 12 kelas, 1 perpustakaan, 1 laboratorium IPA, 2 ruang computer, 1 ruang guru, 1 ruang pegawai, 1 ruang kepala, dan mushola yang mampu menampung seluruh peserta didik saat melaksanakan sholat berjamaah. Selain itu dilengkapi dengan 2 ruang UKS, 3 kantin, tempat parkir motor dan sepeda, 1 ruang BK, tempat wudhu yang terpisah untuk peserta didik laki laki dan perempuan serta 14 toilet. Ada pula 1 aula untuk pertemuan dan halaman untuk upacara bendera. Di bagian dalam ada beberapa gazebo tempat para peserta didik istirahat dan diskusi di luar kelas. Semua bangunan tersebut berdiri di atas tanah dengan luas 4336 m2.. Madrasah melakukan penjaringan aspirasi peserta didik untuk menyediakan sarana dan prasarana yang dibutuhkan peserta didik demi menunjang optimalisasi aktivitas pembelajaran dan aktualisasi minat dan bakat peserta didik. Madrasah juga senantiasa melibatkan peserta didik sebagai upaya menumbuhkan rasa tanggung jawab dalam merawat sarana dan prasarana yang ada.